Департамент здра­во­ох­ра­нения является органом управления ад­ми­нист­ра­ции Брянской области, осу­щест­вля­ющим фор­ми­рова­ние и проведение единой го­сударс­твен­ной политики в сфере охраны здоровья и обеспечения санитарно-эпи­деми­оло­гичес­ко­го бла­гопо­лучия населения области, мо­били­заци­он­ную подготовку здра­во­ох­ра­нения, разработку со­от­ветс­тву­ющих разделов ре­ги­ональ­ных комплексных программ, координацию и ре­гули­рова­ние де­ятель­нос­ти в этой сфере го­сударс­твен­ных органов ис­полни­тель­ной власти Брянской области. Департамент подотчётен ад­ми­нист­ра­ции Брянской области и Ми­нис­терс­тву здра­во­ох­ра­нения и социального развития Российской Федерации. Объектами управления де­пар­та­мен­та являются го­сударс­твен­ные учреждения и предприятия здра­во­ох­ра­нения и аптечной сети области.